Genetické inžinierstvo umožňuje vedcom vytvárať rastliny, zvieratá a mikroorganizmy tým, že menia a vkladajú do nich cudzie gény spôsobom, ktorý v prírode nie je možný. 
 

Geneticky modifikované (GM) organizmy, ktoré týmto vznikajú, sa dokážu rozmnožovať a krížiť s príbuznými, divoko žijúcimi organizmami, a tak nekontrolovane šíriť v životnom prostredí. Prípadné dôsledky sa pritom nedajú vopred odhadnúť.
 
Greenpeace je proti akémukoľvek uvoľňovaniu GM organizmov do životného prostredia. V súčasnosti sú GM organizmy uvoľňované do životného prostredia bez dostatočného vedeckého pochopenia ich dopadov ako na životné prostredia tak aj ľudské zdravie. Toto genetické „znečistenie“ predstavuje veľkú hrozbu, pretože GM organizmy sa po uvoľnení do životného prostredia nedajú vrátiť naspäť.
 
GM potraviny sú ďalším experimentom s nepredvídateľnými účinkami na ľudské zdravie a životné prostredie. Súčasné vedecké pochopenie genetiky je obmedzené a vedci nepoznajú dlhodobé dôsledky konzumácie týchto potravín.
 
Zatiaľ čo napredovanie v oblastiach vedy, ako je molekulárna biológa, predstavuje veľký potenciál pre lepšie pochopenie prírody a objavy nových liečebných metód, nie je to oprávnením na zmenu prírody na jeden veľký genetický experiment. Práve naopak, musí byť chránená a rešpektovaná biologická rôznorodosť, ktorá je globálnym dedičstvom ľudstva.
 
Greenpeace je tiež proti všetkým patentom  na rastliny, zvieratá a ľudí, ako aj ich gény. Život nie je tovar a preto nesmie byť predmetom súkromného vlastníctva.